中藥中發揮藥效物質基礎是中藥進入體內的化合物，中藥化學成分的研究需要對中藥中天然產物進行分離和結構鑒定。而且中藥中天然產物成分及含量也存在地區差異，藥材質量鑒定只從形態上難以滿足，因此需要從化學成分基礎上加以明確并為建立藥材質量標準提供科學依據。中藥中某些天然產物進行分離和結構鑒定也為基于天然產物優勢結構骨架或單元的藥物發現提供物質基礎。